制冷系统的事故可能有:液击、排气压力过高、润滑油供应不足、蒸发器内载冷剂冻结、制冷压缩机配用电动机过载等，为此，制冷系统均应针对具体情况设置一定的保护装置。
高压保护就是是检测系统内制冷剂压力是否正常，在压力超出允许范围时，压力开关动作，并将异常信号传给高压控制器，处理后会停止制冷系统的工作，并将故障显示出来。 低压保护检测的是系统中的回气压力，作用是防止系统压力过低或者没有制冷剂运行而损坏压缩机。如果系统泄漏，没有制冷剂，强制运行将损坏压缩机，这时低压保护可以及时反应，控制系统停止和显示故障，保护压缩机和制冷系统。
防止因润滑油压过低使轴承或其它压缩机内部构件缺油损坏的装置，压缩机油量减少或断油，就将会使高速运行的压缩机遭到严重损坏，油压保护装置正是确保压缩机安全运行的重要部件。 蒸发器如果太脏或者结霜太严重，此时冷气不能和外面的热空气充分热交换而引起内机结冰，室内防冻解保护就是为了压缩机在内机结冰前使压缩机停机，起到保护压缩机作用。防冻结一般会设定一个值，比如3℃，这时室外风扇或降低压缩机转速，提高冷凝压力和蒸发压力，从而提高蒸发温度。如果蒸发器温度进一步降低至0℃以下，压缩机也停止工作。如果室内蒸发器温度升高至正常值时，比如6℃，压缩机和室外风扇正常运行。 室内防冻结保护就是为了压缩机在内机结冰前，能够使压缩机停机，起到保护压缩机和制冷系统的作用。
排气温度过高导致制冷剂分解，绝缘材料的老化，润滑油结碳，气阀损坏，还会使毛细管和干燥过滤器堵塞。保护方法主要是用温控器感应排气温度，温控器应安放靠近排气口处，排气温度过高时，温控器动作，切断电路。 机壳温度会影响压缩机的寿命。机壳温度过高可能起因于冷凝器的换热能力不足，所以应检查冷凝器的风量或水量，水温是否合适，制冷系统内混入空气或其它不凝性气体，冷凝压力就会上升，机壳过热；吸气温度过高，机壳容易过热，此外，电动机过热也会机壳过热。 当线路发生短路时，重要特征之一是线路中的电流急剧增大，这就需要设置相应的当电流流过某一预定值时，反应于电流升高而动作的保护装置叫过电流保护。 设计良好并在规定条件下运转的电动机，内部温度不会超过允许值，但电动机在过高或过低的电压下运转，或在高温环境下运转时，电动机内部温度超过允许值，在频繁起动时，更会因起动电流过大使温度过高。 空调运行过程，会因为各种原因，压缩机停止运行，这时系统中的高、低压力不会马上平衡，如果此时启动压缩机，可能会由于压力问题导致启动电流过大，烧毁空调，因此，目前的空调器均设有延时启动保护，即每次压缩机停止运行后均经过3-5分钟的延迟，才能再次启动。 相序保护是能自动相序识别的保护继电器，避免一些制冷压缩机等因为电源相序接反后（三根火线顺序接反）倒至电机反转从而导致事故或设备损坏。 比如：涡旋压缩机和活塞式压缩机的结构不同。由于三相电源的逆变会引起压缩机的逆变，所以不能逆变。因此，需要安装反相保护器来防止冷水机组的反转。当安装反相保护器时，压缩机可以在正相时工作。当发生相反的相位时，有必要将电源的两条线改变为正相。 相间不平衡电压将会导致三相不平衡电流，从而导致更大的温升—设置过载继电器。在电流的最大相中，温升增加的比例约为电压不平衡比例平方的两倍。如3%的电压不平衡会产生约18%的温升。
